Apparemment, sous Debian, ffmpeg ne prends pas en charge le format xvid. Edite le fichier "/etc/apt/sources.list" et rajoute la ligne suivante :
deb http://www.debian-multimedia.org etch main
(si tu es sous une version testing, tu remplaces "etch" par "lenny").
Ensuite, tu ouvres synaptic et tu cliques sur le bouton "Recharger". Ensuite, tu fais une mise à jours de ffmpeg (il faut que le paquetage "libxvidcore" soit installé).